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Programa
Jueves 25 Junio
Viernes 26 Junio
Lunes 29 Junio
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Clase introductoria a
métodos moleculares
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Clase teórica sobre
diseño de primers de microsatélites en Marathrum
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Laboratorio: PCR para
optimización de primers de Marathrum
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Extracción de ADN
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Preparación de PCR de
ISSR
Martes 30 Junio
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Preparación y carga de
geles de agarosa
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Optimización de PCR
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Discusión de los
artículos: Graves & Schrader, 2008 y Wood & Nakazato,
2009)
Miércoles 1 Julio
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Discusión de los
artículos Zalapa et al., 2009 y Butterworth & Wallace, 2005)
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Colecta de datos de ISSR
(generados durante la clase o de geles hipotéticos)
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Optimización de PCR
Jueves 2 Julio
Viernes 3 Julio
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Presentación de
filogeografia de Quercus subsección Racemiflorae
en México
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El resto del día sera
planeado durante el curso en base a los resultados obtenidos
en los días previos (quizá necesitemos mas tiempo para el
análisis y/o la colecta de datos)
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Instructores:
Dra. Aurea
C. Cortés Palomec
Dr. Ross A.
McCauley
Clases:
Introducción
Desarrollo de
microsatélites
Inferring
geographic patterns and processes of historical gene flow in
Mexican Quercus: a case study of Section Lobatae
Subsection Racemiflorae
Artículo: Graves & Schrader,
2008 (Fiogeografía de Dirca usando ISSRs)
Artículo:
Wood & Nakazato, 2009 (Delimitación
de especies en Ipomopsis
usando AFLPs)
Artículo:
Zalapa et al., 2009 (Hibridización e introgresión en Ulmus
usando microsatélities)
Artículo:
Butterworth & Wallace, 2005 (Filogenia de Pereskia usando
RFLP y Secuencias de cloroplasto)
Lecturas
obligatorias:
Butterworth, C. A. and R. S. Wallace. 2005. Molecular
Phylogenetics of the Leafy Cactus Genus Pereskia
(Cactaceae). Systematic Botany 30(4): 800–808.
Cruzan, M.B.
1998. Genetic markers in plant evolutionary ecology. Ecology
79(2): 400-412.
Ellegren H. 2004. Microsatellites: simple sequences with complex
evolution. Nature Reviews Genetics 5: 435-445.
Graves, W. R. and J. A. Schrader. 2008. At the interface of
phylogenetics and population genetics, the phylogeography of
Dirca occientalis (Thymelaeaceae). American Journal of Botany
95(11): 1454–1465.
Parker,
P. G., A. A. Snow , M. D. Schug, G. C. Booton and P. A. Fuerst
1998. What molecules can tell us about populations: Choosing and
using a molecular marker. Ecology 79(2): 361-382.
Wood, T. E. and T. Nakazato. 2009. Investigating species
boundaries in the Giliopsis group of Ipomopsis
(Polemoniaceae): Strong discordance among molecular and
morphological markers. American Journal of Botany 96(4):
853-861.
Zalapa, J. E., J. Brunet and R. P. Guries. 2009. Patterns of
hybridization and introgression between invasive Ulmus pumila
(Ulmaceae) and native U. rubra. American Journal of
Botany 96: 1116-1128.
Referencias
adicionales:
Archibald, J. K., M. E. Mort and D. J. Crawford. 2003. Bayesian
inference of phylogeny: a non-technical primer. Taxon 52:
187–191.
Beebee, T and
G. Rowe. 2008. An Introduction to Molecular Ecology. 2nd
edition. Oxford University Press, New York, NY.
Eguiarte, L.
E., V. Souza, y X. Aguirre (Compiladores) 2007. Ecología
Molecular. Instituto Nacional de Ecología, SEMARNAT, Mexico D.F.
(Les pasaremos una copia en PDF de este libro durante el curso)
Felsenstein, J. 2003.
Inferring Phylogenies, 2nd. edition. Sinauer Associates,
Sunderland, MA.
Glenn, T. C. and N. A. Schable 2009. Isolating Microsatellite
DNA Loci. Savannah River Ecology Laboratory, University of
Georgia.
Wiley, E. O, D.
Siegel-Causey, D. R. Brooks and V. A. Funk. 1991. The Compleat
Cladist: a primer of phylogenetic procedures. The University of
Kansas, Museum of Natural History, Special Publication No. 19.
Wolfe, A. ISSR Resource
Website, Ohio State University.
Técnicas de
laboratorio:
Extracción de ADN con CTAB
Recetas para
soluciones
ISSR análisis
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